Nel 1878 don Bosco, fondatore dei Salesiani, acquistò a Este la settecentesca Cà Pesaro dai conti Gradenigo su sollecitazione di un parroco di Este e del vescovo di Padova Mons. Manfredini. In quell'anno furono inaugurati i corsi della scuola elementare e del ginnasio. Dagli anni Venti del Novecento vennero aggiunti il Noviziato salesiano per l'Ispettoria delle Tre Venezie e successivamente il Liceo classico e il Liceo scientifico. Negli anni Novanta venne effettuato un cambio di indirizzo chiudendo le scuole esistenti e aprendo la proposta degli istituti professionali.