Fratello di Giovanni Canestrini fu assistente nel Gabinetto di zoologia e anatomia comparata nell'università di Padova, segretario della Società veneto-trentina di scienze naturali e in seguito libero docente in zoologia presso l'università di Pavia e di Padova; contribuì alla formazione della Miscellanea Canestrini conservata in parte presso la Biblioteca Universitaria di Padova. Cfr. la voce di Enrico Tortonese in DBI 18 (1975), pp.